Головная организация обязана вести учет доходов, полученных от нее физическими лицами, отдельно по головной организации и отдельно по обособленному подразделению.
Кроме того, головная организация должна уплачивать исчисленные и удержанные суммы НДФЛ как по месту своего учета, так и по месту учета обособленных подразделений.
При перечислении налога она обязана оформлять отдельные платежные поручения по каждому обособленному подразделению, в которых указываются КПП, присвоенные подразделениям при постановке на учет, а также соответствующий код ОКАТО муниципального образования, в бюджет которого перечисляется НДФЛ.
Такие разъяснения представлены на сайте УФНС по Магаданской области.
Источник: Клерк.ру